復合肥具有養(yǎng)分含量高、副成分少、物理性狀好等優(yōu)點，對于平衡施肥，提高肥料利用率，促進作物的高產穩(wěn)產有著十分重要的作用。但它也有一些缺點，比如它的養(yǎng)分比例總是固定的，而不同土壤、不同作物所需的營養(yǎng)元素種類、數(shù)量和比例是多樣的。因此，使用前好進行測土，了解田間土壤的質地和營養(yǎng)狀況，另外也要注意和單元肥料配合施用，才能得到更好的效果。
一、復合肥肥效長，宜做基肥。
大量試驗表明，不論是二元還是三元復合肥均以基施為好。這是因為復合肥中含有氮、磷、鉀等多種養(yǎng)分，作物前期尤其對磷、鉀極為敏感，要求磷、鉀肥要作基肥早施。復合肥不宜用于苗期肥和中后期肥，以防貪青徒長。復合肥分解較慢，對播種時用復合肥做底肥的作物，應根據(jù)不同作物的需肥規(guī)律，在追肥時及時補充速效氮肥，以滿足作物營養(yǎng)需要。
二、復合肥濃度差異較大，應注意選擇合適的濃度。
目前，多數(shù)復合肥是按照某一區(qū)域土壤類型平均養(yǎng)分狀況和農作物需肥比例配置而成。市場上有高、中、低濃度系列復合肥，一般低濃度總養(yǎng)分在25%-30%之間，中濃度在30%-40%之間，高濃度在40%以上。要因地域、土壤、作物不同，選擇使用經(jīng)濟、高效的復合肥。一般高濃度復合肥用在經(jīng)濟類作物上，品質優(yōu)，殘渣少，利用率高。復合肥濃度較高，要避免種子與肥料直接接觸。復合肥養(yǎng)分含量高，若與種子或幼苗根系直接接觸，會影響出苗甚至燒苗、爛根。播種時，種子要與穴施、條施復合肥相距5-10厘米。
三、復合肥配比原料不同，應注意養(yǎng)分成分的使用范圍。
不同品牌、不同濃度復合肥所使用原料不同，生產上要根據(jù)土壤類型和作物種類選擇使用。
含硝酸根的復合肥，不要在葉菜類和水田里使用；含銨離子的復合肥，不宜在鹽堿地上施用；含氯化鉀或氯離子的復合肥不要在忌氯作物或鹽堿地上使用；含硫酸鉀的復合肥，不宜在水田和酸性土壤中施用。否則，將降低肥效，甚至毒害作物。
復合肥中含有兩種或兩種以上大量元素，氮表施易揮發(fā)損失或隨雨水流失，磷、鉀易被土壤固定，特別是磷在土壤中移動性小，施于地表不易被作物根系吸收利用，也不利于根系深扎，遇干旱情況肥料無法溶解，肥效更差，所以復合肥應深施覆土。